谁知好景不长。1507年，葡萄牙人发现了这个美丽的岛屿，发现了这种温驯的鸟，从此，渡渡鸟面临着厄运。
渡渡鸟从来没有看到过人，不知道人类对它们的危险。它们对人类没有丝毫戒备之心，见到人，也不知道躲避和藏匿。渡渡鸟身体庞大，行走慢慢，人们用刀、枪很容易将它捕杀。捕杀渡渡鸟成为人们业余生活的一部分，渡渡鸟成为人们餐桌上的佳肴。
狗和猪也成了帮凶。狗行动敏捷，见到渡渡鸟就会穷追不舍。猪是十分贪吃的家伙，它们贪婪地吃渡渡鸟的蛋和雏鸟，还用大鼻子把巢拱得乱七八糟。
渡渡鸟有翅不能飞，有脚走不快，有爪不能斗，根本无法保护自己也无法保护自己的后代。因此渡渡鸟越来越少，1681年，最后一只渡渡鸟消失了。从此，毛里求斯国内再也见不到这种温驯的大鸟，地球上再也没有这种鸟了。
坦普尔猜想，渡渡鸟的灭绝，给大颅榄树带来了生存危机，它与渡渡鸟有共生作用。鸟以树的果实为生，又为树的种子催生。树的种子被坚硬的果壳包裹着，无法吸收水分，无法生出幼芽。渡渡鸟的胃囊有很强的消化作用，经过渡渡鸟胃囊的消化作用以后，硬壳被磨薄，就容易发芽了。而自从1681年渡渡鸟灭绝后，树失去了“接生婆”，果实中坚硬的果壳扼杀着种子的生机，生命的信息就无法萌动，果壳里的生命只能一直处于沉睡状态。就是种子得到了一点水分，开始萌芽了，嫩弱的幼苗也没有能力冲破硬壳的束缚。大自然原来设计用以保护种子的硬壳成了扼杀生命的桎梏。大自然在渡渡鸟灭绝以后，没有什么生物能为大颅榄树的果实做硬壳变薄处理，它就不再能够生育后代了。